У Придніпровському науковому центрі створені різні секції за напрямками наук, три методичних ради та кілька інноваційних технологічних кластерів. Всі підрозділи Центру мають персональні сторінки на нашому сайті, переходи на які відображені нижче. На кожній сторінці можна знайти необхідні робочі матеріали, які будуть постійно доповнюватися в залежності від результатів роботи підрозділів.
Секции: 1. Актуальні проблеми теоретичної та прикладної механіки. 2. Біологічні науки. 3. Гірничі науки. 4. Медичні науки. 5. Металургія. 6. Суспільні та гуманітарні науки. 7. Педагогічні науки. 8. Сільськогосподарські науки. 9. Будівництво та архітектура. 10. Фізико-математичні науки. 11. Хімічні науки. 12. Економіка. 13. Енергетика та Енергозбереження. 14. Юридичні науки.
Методичні ради: 1. Рада з проблеми «Антропогенний вплив на зміну клімату».
2. Рада по роботі з молодими вченими.
3. Рада з викладання інноваційних дисциплін у ВНЗ.
4. Рада проректорів і заступників директорів з наукової роботи ВНЗ і НДУ.
Інноваційні технологічні кластери: 1. Гірниче машинобудування. 2. Металургійне машинобудування. 3. Моторобудування і авіабудування. 4. Ракетно-космічна техніка. 5. Сільськогосподарське машинобудування. 6. Транспортне машинобудування і технології перевезень.